Университет осуществляет свою образовательную деятельность на основании:

1. Закона Республики Казахстан «Об образовании».
2. Устава, утвержденного Правительствами Казахстана и Турции (1993, 2012).
3. Закона Республики Казахстан «О ратификации Соглашения между Правительством Республики Казахстан и Правительством Турецкой Республики об условиях деятельности Международного казахско-турецкого университета имени Ходжи Ахмеда Ясави и Протокола о внесении изменений в Соглашение между Правительством Республики Казахстан и Правительством Турецкой Республики об условиях деятельности Международного казахско-турецкого университета имени Ходжи Ахмеда Ясави от 22 октября 2009 года» (№ 531 от 9 января 2012 года).

Генеральной лицензии МОН РК на ведение образовательной деятельности №0137408  от 03.02.2012 года.
Нормативно-правовая база

Если в результате первого набора в 1991 году в университет было принято 332 студента, то нынешний контингент студентов составляет около 10 000 студентов, интернов, магистрантов и докторантов, в том числе около 1,5 тысяч студентов (15% от контингента) из тюркоязычных стран ближнего и дальнего зарубежья.

Подготовка специалистов осуществляется по 54-ми специальностям бакалавриата, 30-ти специальностям магистратуры, 11-ти специальностям докторантуры PhD, 3-м-резидентуры и 7-ми интернатуры в области естественных, гуманитарных, экономических, юридических, социальных, медицинских, технических наук, специальностям образования, бизнеса, услуг и искусства (http://ayu.edu.kz/ru/barlyk-mamandyktar/list-of-specialties).

В состав университета входят:

1. 10 факультетов:

• филологический факультет;
• факультет социальных наук;
• факультет гуманитарных наук;
• факультет естествознания;
• факультет инженерии;
• факультет искусств;
• медицинский факультет;
• стоматологический факультет;
• факультет медицинского последипломного образования;
• подготовительный факультет.

2. Высшая школа государственного управления и экономики.
3. Профессиональный колледж «Ахмед Ясави».

Многоуровневая система образования МКТУ им.Х.А.Ясави в соответствии с требованиями Болонского процесса включает: высшее базовое образование (бакалавриат, интернатуру,  магистратуру, резидентуру и докторантуру). Прием в МКТУ им.Х.А.Ясави осуществляется по государственным образовательным грантам, на договорной основе и по турецким образовательным грантам (квотам).

В 2018-2019 учебном году:

• осуществлена трансформация и гармонизация образовательных программ, ориентированных на передовой мировой опыт ведущих вузов, а также современных принципов практикоориентированного обучения по модели «Завод-Университет» и «Major and Minor»;
• на постоянной основе осуществляется обмен европейским опытом и методиками через иностранных профессоров и специалистов, их приглашение в университет с целью трансляции новых инновационных технологий в процесс обучения;
• разработаны образовательные программы по системе дуального обучения с «Кентауским  трансформаторным заводом» для технических специальностей и экономики на уровне бакалавриата;
• по педагогическим специальностям в учебные программы внедряются новации в средней школы (обновленное содержание, критериальная оценка,критическое мышление и др. по опыту НИШ) ;
• создана Высшая школа государственного управления и экономики на основе проектного подхода и опыта Академии госуправления при Президенте РК и Назарбаев Университета;
• расширены программы академической мобильности студентов с зарубежными вузами;
• внедрение образовательных программ 3+1, Эразмус +, программы двойного диплома, практики обучающихся зарубежом в западных вузах по направлениям;
• внедрен мировой опыт в систему управления университета посредством совершенствования профессиональной квалификации в области менеджмента в зарубежных учебных заведениях в рамках программ Болашақ, Мевлана, Эразмус и т.д.;
• увеличена доля остепененных преподавателей посредством целевого обучения в Турции по программам магистратуры и докторантуры PhD;
• Создаются элементы развития инновационной инфраструктуры (оффис комерциализации технологий, технопарк, стартапы и др.);
• создан тренинговый Центр профессионального развития (для ППС и работников университета), где осуществляется повышение профессионального мастерства и компетенций преподавателей, совершенствование их профессиональных навыков путем трансляции опыта ведущих университетов (Назарбаев Унтиверситет, университеты Мармара, Гази и др.);
• ведется работа по открытию новых перспективных специальностей, как агрономия, ветеринарная медицина, строительство, архитектура, проектный менеджмент в соответствии с потребностями экономики и социальной сферы новой Туркестанской области;
• ведется активная работа по обновлению учебных программ с работодателями, Туркестанским филиалом НПП «Атамакен»;
• Университет располагает лабораториями, интернет-классами, спутниковой системой видеоконференции (лекции ведущих зарубежных ученых в режиме онлайн), компьютерами нового поколения, учебными кабинетами, где размещены лабораторное оборудование, макеты, способствующие интенсификации учебного процесса и проведению научных исследований;
• на основе опыта Назарбаев Университета решением Межправительственного Полномочного совета на подготовительном факультете открыта программа «Foundation», цель которой многоуровневое углубленное обучение слушателей английскому языку и турецкому языкам. На данную программу по итогам республиканского конкурса принимаются граждане Казахстана получившие гранты Турции и иностранцы, поступившие на гранты Правительства Казахстан. Успешно завершившие учебу по программе «Foundation» зачисляются на 1 курс избранной ими специальности бакалавриата и далее обучаются в специальных полиязычных группах;
• ежегодно проводится Республиканская предметная олимпиада «Ясави» (в режиме онлайн и очно в финале). Победителям олимпиады вручаются образовательные сертификаты на безвозмездное обучение в университете.

МКТУ им.Х.А.Ясави – единственный университет в Казахстане, который имеет две собственные клиники – медицинская на 120 койко-мест (клинико-диагностический центр) и стоматологическая поликлиника, где студенты-медики совмещают обучение с практикой.
Клинико-диагностический центр (Клиника)  создан как мощная практическая база медицинского факультета университета, современное прогрессивное учреждение, полностью отвечающее стандартам, оснащенная современным диагностическим оборудованием.
Строительство Клинико-диагностического центра было профинансировано Турецкой Республикой, завершено в 2006 году. В настоящее время клиника предоставляет качественные медицинские услуги  жителям города Туркестана и других  регионов страны.
Деятельность Клиники реализуется в трех главных направлениях: оказание медицинской помощи, подготовка студентов-медиков и последипломная подготовка врачей. Она оказывает стационарную специализированную и высокоспециализированную медицинскую помощь,  специализированную неотложную медицинскую помощь, функционирует травматологический пункт с мощностью 50-60 посещений в смену.
Ежегодно за медицинской помощью в  клинику обращаются до 65 тысяч человек, стационарное лечение проходят около 7 тысяч, проводится около 1500 оперативных вмешательств повышенной сложности.
С 2019 года начинает свою работу стоматологическая клиника, оснащенная современным оборудованием.

В 2001 году создан международный виртуальный институт ТурТЕП (Турецкие образовательные программы на турецком языке), расположенный в Анкаре и реализующий образовательные программы 3-х уровней: колледж – бакалавриат – магистратура по 16-ти специальностям среднего, высшего и послевузовского образования с контингентом около 7 000 обучающихся из Европы, Турции, СНГ, Казахстана, 120 профессоров из ведущих университетов Турции. Сегодня ТурТЕП – это лидер в области онлайн образования, опыт которого перенимают ведущие вузы Турции.
На основе положительного опыта ТурТЕПа в январе 2016 года решением Межправительственного Полномочного Совета открыт Институт дистанционного образования КазТЕП в Туркестане  (дистанционная образовательная технология обучения на казахском языке) по 5 специальностям магистратуры в пилотном режиме. Наработанный опыт дистанционного обучения в КазТЕПе с 2019 года будет реализован по 20-ти специальностям бакалавриата и 8-ми специальностям магистратуры.
Целевая аудитория КазТЕПа – это занятые на производстве трудовые ресурсы страны, желающие дистанционно получить второе высшее образование или после колледжа, а также магистерские степени независимо от времени и места своего нахождения на основе лучших современных образовательных практик, при максимальной гибкости графика и образовательной траектории.
На сегодняшний день виртуальная образовательная площадка КазТЕПа может предоставить своим обучающимся качественные знания на основе:

• привлечения ведущих ученых и профессоров Республики Казахстан для разработки авторских дистанционных курсов;
• эффективного использования современных IТ технологий;
• аккумулирования возможностей ведущих ученых и специалистов из всех вузов и производства;
• практических вебинаров, проводимых тьюторами-лучшими практиками в своей области;
• индивидуального графика обучения с гибкой формой оплаты.

При разработке образовательных программ были привлечены крупные специалисты по отраслям, имеющие признанный авторитет в своих областях, а также подробно был изучен рынок труда и специфика подготовки специалистов другими вузами.
Цель КазТЕПа – на основе международного опыта построить новый вектор дистанционного образования в сфере высшего и послевузовского образования Республики Казахстан.